太平洋戦争末期に1945年3月10日のアメリカ軍の東京大空襲による甚大な犠牲が発生した。警察隊は3月16日に上野公園の両大師脇にて、特に下谷・渋谷などから集積された民間人の焼死体や窒息死体の処理するために、集団墓地の穴を掘った。無差別な東京大空襲による犠牲者の大量の焼死体を、土中に埋葬した。3月10日以降の空襲では、膨大な死体の集積されて、戦場掃除のような死体処理を乱暴な扱いで死体が処理された。個別の埋葬ができない死体は、公園や寺院の境内などに集団墓地の穴を掘って、死体を埋めてから仮埋葬した。1945年3月から5月の東京空襲では、約9万4800の死体で、個別に埋葬された約8000人以外は、それ以外は集団埋葬された。終戦後に、集団埋葬により仮埋葬した死体を3～5年後に掘り返して火葬した。遺骨は東京都慰霊堂に安置されて、約8万人の遺骨が無縁で残存した。
東京の第1回目の初空襲は、アメリカ軍の爆撃機B-25の13機により1942年4月18日に爆撃した。空襲は東京市民にとって青天の霹靂であり、初めて戦争を実感した。空襲を知らない一部の市民は，待避を叫ぶ声に避難もせず，空上を参観しげた。2年半ぶりの1944年11月24日が第2回目の空襲となった。主に軍事工場と産業工業から、その後は次第に市街地に対して、アメリカ軍の空襲は激しさを増した。東京の空襲被害状況の写真は、軍部のみの厳命で検閲された。
東京大空襲となった1944年3月10日を迎える。房総半島沖からアメリカ軍の爆撃機Ｂ29の約279機は、超低空で午前0時25分頃に江東地区を空襲した。1556トンもの焼夷弾を投下して、住宅の密集地に無差別に大空襲した。周囲は猛火の壁に囲まれ，北西からの熱風に煽られた。アメリカ軍爆撃機Ｂ29は巨大な真っ白い胴体に、真紅の焔を反射させ，低空で乱舞して、焼夷弾の束を無数に落下した。火は倍々たけりたって強風を呼び，強風は火を煽って，多くの逃げ惑う人びとを焼殺や窒息死した．倒れた死体は路面を激流の大火流に，芋俵を転がるように流された。
東京大空襲の民間人の犠牲者は、東京都内が被害を受けた空襲は60回を越えた。確認された死者の死体数は約10万5400人に上った。負傷者は約15万人で、罹災者は約300万人、罹災住宅戸数は約70万戸であった。焼失面積は約140㎢で、区部の市街地の約50％、区部面積の約25％に当たった。東京都全体では、空襲は100回を越えた。アメリカ軍は市民を大量虐殺して、日本中で戦争継続の士気を喪失させる戦争犯罪で狙った。
