ソビエト軍が1939年に西ウクライナのゾーチロウを占領後に、ソビエト秘密警察(NKVD:内務人民委員部)は、ウクライナとポーランドの民族主義者、政治家、知識人をゾーチロウ城に投獄して、少なくとも約649人が虐待されて中庭で虐殺された。
NKVDは西ウクライナ全域で、1941年6月23日からウクライナ人政治犯から大量死刑が始まった。当初は、NKVDは虐殺処分はウクライナ西部地域の囚人から、後に他の地域に広がった。約2週間で、ソビエト軍は約22,000人以上を殺害した。1941年にウクライナ西部でNKVDが刑務所で大虐殺を執行した。1941年6月22日、ドイツとソビエトの東部戦線で戦争が勃発すると、ソビエト軍にとり、多くの囚人がいる刑務所が問題となった。最初にウクライナ西部最大のリヴィウ刑務所(ロンスキー刑務所)で、約5000人以上の反革命活動の囚人がいた。
解決する最初の措置は、ソビエト軍が登録した囚人を2つの集団に分割した。強制労働収容所あるいは虐待されて虐殺された。ドイツ軍から囚人の逃避には、リヴィウから約4万5千人の囚人を逃避させる計画であったが、刑務所に残っていた3,000人の囚人は、即座に射殺された。最初は特別な穴で、後頭部を狙って撃たれた。ドイツ軍が近づくと、囚人らはは地下室に追いやられ、窓から機関銃を撃ち抜かれた。死体はトラックに運ばれ、塩で覆われた掘られた穴に捨てられた。ナチス・ドイツ軍が到着する前に、処刑された人々は刑務所の地下室に投げ込まれた。テルノーピリ地域では、ドニエストル川を渡る囚人を乗せた約14台の貨車が破壊された。貨車には燃料をまき散らし、火をつけて、川に捨てられた。ドニエストル川の急勾配の土手で、約1,000人以上の囚人が虐殺された。
約2,000人以上の囚人がルスク刑務所で射殺された。若いウクライナ人、民族主義者組織、聖職者、そして知識人らも射殺された。6月22日に、ルツクがドイツ軍に爆撃され、囚人は6月22日から23日まで一晩中刑務所で射殺されて、約625人の囚人だけが生き残った。囚人の死体には灯油が注がれて燃やされ、石灰が振りかけらた。6月23日以降、さらに死刑執行は激化した。ソビエトが撤退する前の最後の数日間、機関銃と手榴弾で処刑された。犠牲者の苦悶する叫び声を消すために、轟音を立てる自動車とトラクターのエンジンで轟音立てて死刑が執行された。同様な虐殺が、ウクライナの中央東部地域であるウマニ、キエフ、ハリコフの強制収容所でも勃発した。