神風が激突して爆発したアメリカ軍の空母バンカーヒルの格納庫では、ガソリンの燃焼と弾薬の爆発による火災が続き、炎上する空母の飛行甲板の何百フィートも上から、刺激的な黒煙が立ち上った。飛行甲板や格納庫、準備室では、多くの水兵、特にパイロットが沖縄上空での任務に向けて離陸準備をしていた。神風が激突してすぐに多くの人が亡くなり、海に飛ばされたり、生きたまま焼かれたり、煙を吸ったり、窒息したりして悲惨な戦死した死体が散乱した。火からの燃えるガソリンと有毒ガスが換気システムに吸い込まれて、準備室の外にある通路で、人が薪のように積み上げられて、全員約22人が窒息死していた。甲板下の機関室では約125人が犠牲となった。神風によって、バンカーヒルの乗組員は合計で393人が戦死して、約43人が行方不明、約264名が戦傷した。1945年5月12時正午から夕方まで、死体は帆布の袋やパラシュートは縫われて閉じられ、飛行甲板に並べられ海に埋葬された。その後に自力で真珠湾まで帰還して、1945年8月中旬の終戦時にまだ造船所にいた。
日本軍の軍事拠点を破壊し続けたバンカーヒルは、1945年5月11日に2機の神風から悲惨な突撃を受けた。晴れ渡っていたが、午前10時5分頃に、沖縄戦のために数機のアメリカ軍の戦闘機が離陸する最中に、日本軍の神風がレーダーに探知されずに、バンカーヒルの右舷側の雲の中から低空飛行してきた。広大な護衛艦のスクリーンをすり抜けて、右舷に低空を飛行した。約34機の戦闘機が離陸準備をしているフライトデッキの真上に約250Kgの爆弾と零戦は激突した。神風は木製の飛行甲板を突き破り、格納庫から甲板の頭上を通って海上に落下して大爆発した。爆弾の破片と神風本体は、飛行甲板で離陸準備をしていた戦闘機に激突して、爆発の連鎖反応引き起こした。大規模な火玉と煙が船尾に飛び散り、何人もの水兵が吹き飛ばされた。
その30秒後には、2機目の神風が約250kgの爆弾とバンカーヒルの飛行甲板に激突した。爆発は、格納庫甲板とその下の準備室を切り裂いた。燃料を補給して武装した戦闘機の乗務員たちが、離陸するために上甲板に向かう準備をしていた。40ミリ砲弾を受けながらも零戦をバンカーヒルに向けて操縦した。3機目の神風は、空母にとどめを刺すために飛んできた。バンカーヒルの砲手たちは、神風を撃退し続けた。甚大な損害を受けた船内では燃え盛る火の粉を消すために消火活動が行われた。爆発で船外に飛び出す水兵もいれば、火災で船尾の水兵を中心に海に飛び込む者もいた。逃避した1人の将校は、後に自分自身を救うために味方を残したとして軍法会議にかけられた。
