日本軍が武漢を1938年10月26に陥落した時に、約4,000人もの中国人が大虐殺された。集団埋葬された死体が、湖北省黄陂県で発掘された。黄陂県は、中国の湖北省武漢市の中心部から北部に位置する。日本軍の武漢占領には、武漢の人口は急激に減少して、中国人住民による大規模な暴動が頻繁に発生した。武漢作戦で、日本軍は約9,500人が戦死して、約26,000人が戦傷した。中国側の犠牲は、約195,500人の死体が遺棄されて、約11,900人が捕虜となった。
1937年7月７日に盧溝橋事件が起きて、日中戦争が勃発した。1945年8月15日に日本は降伏するまで、約8年間も続いて、多大な被害と犠牲をもたらした。日中戦争により、2200万人の犠牲者が出た。期間と規模が最も大きな戦争は、武漢会戦（漢口攻略・武漢作戦）であった。日本軍は、1938年6月11日から10月27日の武漢作戦で武漢を占領した。1937年12月に南京陥落後に、中国国民党政府が撤退して、首都を武漢を遷都した。日中戦争は、12月13日に首都南京の陥落を招き、国民党政府は武漢、ついで重慶への遷都を余儀なくされた。11月20日に、国民党政府は、日本軍の首都南京侵攻を直前に前に重慶への遷都宣言を公表して移転を開始ていた。
1938年6月に、日本軍は国民党政権を打倒するため、武漢を侵攻した。中国国民党政府は1938年6月に、武漢のあらゆる種類の産業と軍事施設を移転または破壊を決定して、武漢の産業の損失は約70%に達した。国民政府は中国共産党と全国人民から支援を得て、大規模な武漢会戦が勃発した。中国軍は1938年6月11日から約4か月も戦闘したが、10月26日に武漢が陥落した。中国軍は、日本軍の侵略に対する抵抗戦争は戦略的に膠着状態に陥った。時点から約6年9か月間占領された。武漢を占領にて、日本軍は武漢を湖北乃至華中地域を支配するために、武漢市内も周辺も日本軍兵士が駐屯した。日本軍は1939年4月に武漢で仮武漢特別市政府を設置して、直接日本軍が支配した。
日本軍の1945年8月15日の敗戦後には，1946年5月1日に中国国民党政府は重慶から南京に遷都した。1948年1月政府の名称が中華民国政府と改称された。国共内戦に敗れて 1949年に首都を南京から広州，重慶，成都，台北へと順次移転させた。
