ユーゴスラビアの連邦国は、少数派を血まみれに追放して、共産主義のユーゴスラビアが崩壊後に、独立を宣言した。コソボ紛争でアルバニア人たちが、1999年1月15日にセルビア人によってラチャック村で無差別に虐殺された。血まみれのアルバニア人の約46の死体が散乱した。
1945年以降にコソボのアルバニア人の少数民族は、90%もの多数派に達した。 1981年にこの地域から騒乱が始まった。スロボダン・ミロシェビッチは、セルビア人の少数派の代表者になり、後に大統領となった。1986年に、ユーゴスラビア共産党をセルビア社会党に改名した。1989年にコソボの自治を廃止して、アルバニア人幹部をセルビア人に置き換えた。
1980年代末に、民族主義者らは共和国の権力を引き継いだ。クロアチアとスロベニアは、1991年6月26日に独立を宣言した。ユーゴスラビア軍は両国に進軍したが、すぐにスロベニアから撤退した。クロアチアの3分の1は占領を継続した。居住するセルビア人の少数民族はクライナ共和国の独立宣言した。
1990年11月のボスニアの総選挙で、アリヤ・イゼトベゴヴィッチが率いるイスラム教徒民主化党が過半数を獲得して、1991年に独立宣言した。ボスニアのセルビア人少数派は、ラドヴァン・カラジッチの下でセルビア共和国は独立宣言した。セルビア人は、ユーゴスラビア軍の支援でボスニアの3分の2を占領した。追放と大量虐殺による残忍な民族浄化が行われた。北太平洋条約機構(NATO)は1995年に内乱の抑止のため介入した。約220万人が残酷な難民となり、約20万人が殺害された。国連の監視下でボスニア・クロアチア連邦とセルビア共和国に分割され独立国家とした。
1995年にクロアチア軍は、クライナ共和国を再占領した。追放されたセルビア人はコソボに逃避した。1992年にアルバニア人はイブラヒム・ルゴバの下でコソボ共和国を独立宣言した。コソボ解放軍とセルビア人治安部隊と激戦となり、セルビア人勢力が攻勢に至った。NATOはセルビアに対する空爆とコソボの占領に介入した。数千人のイスラム教徒のボスニア人は、1995年にボスニアのセルビア人地域から逃げた。NATOはセルビアに対する空爆とコソボの占領に介入した。
マケドニアも1991年に独立を宣言した。マケドニアの少数派アルバニア人はイリリア共和国を宣言し、2000年に解放軍を創設した。コソボから約25万人の難民が発生した。 NATOと国連軍は戦争の暴発を抑止した。
